基金會不是唯一對超自然物品感興趣和投入研究的組織。
還有許多組織持有、使用或者試圖創造SCP物品，他們有得是為了自己的利益，有得是為了保護人類。
有些是基金會的敵人，有些是基金會的分支，有些是基金會可以信任的伙伴，有必要撰寫一份基金會所知機構的簡報，和對基金會所持的立場的報告並分發下來。
Alexylva University／Alexylva大學
對Alexylva University及其動機只有很少的訊息。
證據指出該組織至少在西半球被拉丁文明和希臘文明所交替的領域維持著統治；至今沒有任何關於這個世界其他部分的資料。
所有與其相關的物品都發現於美國中南部，更確切的說是在田納西州，使得基金會研究員相信該組織本身位於該地理區域。
許多與該組織相關的物品（但據信不是他們製造的）都回收於一叫“Phitransimun Combine”的中介機構並都附有相關文件，使得基金會可以輕易了解物品的性質以及其原始位置。至今，所有已知被傳送的物品都是使用一種類似於愛因斯坦-羅森橋的科技，該科技在當代科學中被認為是一種純理論性的技術。該組織有一個特殊部門叫做Department of Natural Philosophy （自然哲學部），經確認是負責運輸的部門，可能並不知道和了解該組織的其他部分。
>與Alexylva University有關聯的編目SCP包括：
SCP-877、 SCP-961、 SCP-1043、SCP-1080、SCP-1081、SCP-1083、SCP-1546和SCP-1998。
Are We Cool Yet?
一小部分的“藝術恐怖分子”，Are We Cool Yet?的成員有能力同時獲得和生產異常項目和個體，並用這些物品創造藝術裝置。這些裝置被放置在暴露於大量公眾的地方，並經常不過不是全部-對旁觀者是致命的；短語“are we cool yet?”經常存在於某些方面。
>與Are We Cool Yet?有相關的異常項目包括：
SCP-1018、SCP-1043、SCP-1057、SCP-1074、 SCP-1999還有transcript of intercepted broadcast（攔截到的廣播文字稿）。
The Chaos Insurgency／混沌分裂者
Insurgency是從基金會分裂出去的一個機構，在1924年由一個擅離職守並攜帶數個高價值SCP項目離開的外圍組織所建立。
在那之後，Insurgency成為世界舞台上的另一個重要角色，為了獲得它自己的利益而使用SCP物品，並鞏固自己在全球的權力基礎。 Insurgency除了SCP項目以外，也運作武器流通和情報收集業務。
它利用第三世界國家的獨裁制度，經常像基金會使用D級人員那樣使用這些國家的人口進行研究。
因此，它一直使這些國家保持赤貧和內戰狀態，這樣它才能繼續進行激進的實驗，並更容易取得人力資源，以及和叛軍陣營進行的有利可圖的業務。
Insurgency持有的大部分SCP目前未知，而那些已知的，最引人注目的是“Staff of Hermes”，這個SCP可以改變任何它所觸及的物質的物理和化學屬性。
以及“Bell of Entropy”，取決於它所轟擊的地方，該SCP可以造成各種破壞性影響。
所有這些SCP物品在最初時都是基金會花費了不小的代價來取得，而現在都被Insurgency的創始人所偷取。
同時現在也已知Insurgency和SCP-355及SCP-88聯繫所關聯。
Insurgency的主要基地和領袖目前未知。該組織對基金會持直接對抗的態度，曾與基金會有數次衝突。
所有人員應注意來自Insurgency的可能的襲擊、恐怖企圖和間諜行動，並須報告任何關於其所屬人員的任何異常舉動。
The Church of the Broken God／破碎之神教會
在發現並回收SCP-882不久後，數名該“教會”的成員前來並要求歸還“神之心”。
其首領是Robert Bumaro，他們是一群狂信者，他們相信大部分SCP物品是“神”在創造宇宙之後碎裂成的碎片。透過將“神”恢復到完整狀態，他們同時也將獲得神性。
自從第一次接觸後，另外兩個“神”的關鍵部件被暫時證實了：SCP-217和SCP-271。
他們對於基金會有高度敵意，宣稱基金會是“異教徒”，試圖消滅基金會人員並突破SCP物品收容設施。
目前仍不知道他們如何檢測到SCP物品，不過他們被證實對於尋找SCP物品擁有可怕的準確度。
另外，他們也被證實擁有抵抗SCP心理影響的能力，特別是SCP-882和它的“心理誘惑”。
教會同時被視為基金會和SCP物品的威脅。該組織成員應被強行拘留，或者由基金會特工用任何必要手段消滅。
Doctor Wonderainment／ Wondertainment博士
Wondertainment博士是個人還是組織目前未知。
已知的只有Wondertainment博士有能力製造主題是兒童玩具的超自然物品和個體。
其餘工廠的聯繫目前仍舊是猜測和未經證實的。
>當前的已知造物為：
SCP-445、SCP-549、SCP-846、SCP-905、SCP-909、SCP-913、SCP-917和SCP-920。
The Factory／工廠
關於工廠的已知訊息非常少，似乎他們有能力製造超自然物品——而且他們似乎擁有量產的技術。
>當前的已知造物為：
SCP-248 、SCP-585、SCP-690、SCP-719、SCP-720、SCP-721和SCP-750。
The Fifth Church／第五教堂
「別的教堂看這個教堂就像人們在看小丑。這只是表面上類似而已，不過錯誤事情被強調和誇大所以你不能讓事情變得糟糕……當然，它不會出來抓你，不過這意味著什麼？為什麼它在那裡？如果它召喚你的話又會發生什麼？」
-█████博士
第五教堂，同時也被稱為Church of Fifthism或the Fifthist Fellowship，是一個透過娛樂業緊急結合的高度機密宗教組織。
儘管進行了大量調查，在2007年的全國范圍醜聞（2007 nationwide sting），即已知的占星師行動中達到頂點，沒有進一步有關其教義、職能、成員數量，或其目標的訊息被確認，儘管監視表單上已經有100個確認和懷疑的組織要人和其他突出人物。
其組織存在於20世紀中期多個時間點和北美和亞洲的多個位置，不過一些來源確認其在數個世紀前就存在。
第五教堂從未直接與基金會進行交流，不過它被視為一個敵對勢力。
>從該組織獲得的項目且當前置於基金會控制下的有：
SCP-1523、SCP-1982、SCP-1724和SCP-1425。
The Global Occult Coalition／全球超自然聯盟 （GOC）
GOC在二戰的善後工作中成立，為了處理那些來自蘇聯、同盟國和納粹遺留的叛逃神秘學者，靈媒，祭祀和科學家，這些國家聚集在一起並組成聯盟。正如世界舞台在擴大，也有更多的國家加入GOC，一直到了今天的規模。
GOC是一支龐大的政治力量，他們將自己視為超自然世界的警察。他們對於摧毀超自然個體感到非常驕傲，並使用那些從他們的贊助者手裡得到的各種高新實驗技術。很多潛在的SCP物品在被基金會獲得和收容之前就被他們摧毀了。
他們和基金會的關係亦敵亦友，取決於形勢。他們對於基金會研究和使用SCP而不是摧毀SCP物品持蔑視態度。但GOC尊重基金會的強大而不干涉其業務，但有數起可疑的事故可能與GOC有關，雖然他們完全否認這點。
應當以懷疑的態度對待GOC的特工。
>GOC已知已經牽涉到SCP-1609和SCP-1899。
GRU Division "P"／ GRU部門“P”
原本名稱為GRU異常狀況委員會，在1935年由JV Stalin直接下令建立，其第一個目標是調查針對SM Kirov的謀殺。
在二戰期間，委員會擴編為部門“P”-超心理學，用於對抗來自黨衛軍（SS），聖遺物，和梵蒂岡的異常威脅，並捕獲和研究來自國內和國外的異常物品以使蘇聯政府受益。部門“P”在冷戰期間繼續擔任此角色，使得基金會在共產國際國家中的行動變得十分困難。
在1991年後，由於預算削減和匆忙改組，人員退役並出售大量資產，導致有大量人員（註：東歐的大部分混沌分裂者和MC&D僱員都來自部門“P”序列）叛逃。並使得歐洲黑市上充滿了原本屬於該組織的異常物品。當前，此組織對基金會只有很小的威脅。
>原本屬於GRU部門“P”的項目有：
SCP-1011、SCP-1723和SCP-1232。
The Horizon Initiative／ 地平線倡議
HI是以三個主要亞伯拉罕教派和其他有影響力的教派一起在1960年代晚期創建的組織，以用於應對異常物品數量的增長和他們察覺到的威脅。儘管其目標仍不完全明確，HI已知將SCP物品視為目標，並會回收或摧毀它們，這取決於每個物品在其教條中的位置。
該組織由來自涉及其創立的三個主要教派的領導們組成的一個法庭所控制，儘管由於大量的內訌導致其官方領袖無法完全控制組織。 HI的主要戰鬥力量， Project Malleus，主要部署用於反邪教行動和回收SCP行動。
該組織與大多數其他相關組織和基金會的關係處於一種等同狀態；任何與破碎之神教會和第一第五教會有關的事將被以高度敵對對待（在此時在武裝行動中與他們交戰），對基金會和GOC的態度則有很大變化，從公開敵對到有限度的合作，取決於其個體成員在組織內部的歸屬陣營。
Manna Charitable Foundation／ 瑪娜慈善基金會
在1971年成立，作為一個多信仰的人道主義救援機構，回收的文件描述瑪娜慈善基金會的任務是「對神最後的子孫分享神所有的奇蹟」。
透過各個慈善團體和宗教組織間接提供資金，並偶爾有富有的慈善家或學術機構進行公開贊助，自發現其以來，MCF的主要議程是自由分配SCP物品，或其副產品，給那些第三世界貧困地區或那些遭受戰爭、飢荒或自然災難折磨的區域的平民。
MCF當前被聯合國認為是一個非政府組織，並已知在基金會影響範圍外的敵對或封閉地區進行合法和非法的活動。
至今為止MCF作業員分配的SCP物品都沒有導致對人類或社區的嚴重損害（被扣留的MCF作業員都顯示出強烈的和平主義），且與該組織相關的收容失效也沒有導致人員傷亡，從其收容中釋放的項目也沒有由於不可預料的後果而對全球局勢產生嚴重威脅，這些被分發的可能“有用”的物品似乎也都是經過對其長期行為的嚴格科學研究後才被分發的。
>與瑪娜慈善基金會有關的項目包括：
SCP-1135、SCP-1176和SCP-1615。
Marshall， Carter， and Dark Ltd.／ Marshall，Carter和Dark有限公司
一個以英國倫敦為基地的“俱樂部”。透過服務超級富豪和全球範圍內廣泛的政治和金融關係。
這個組織給基金會造成的麻煩正不斷擴大。 Marshall，Carter和Dark有限公司（以下簡稱MCD）已知正在收集各種超自然物品，向它的成員提供獨有的，珍貴的，罕見的經歷。
這些行動已經造成了與基金會的數次衝突；該組織並不懂得使用超自然力量；他們更偏好使用強大的經濟和政治壓力來完成他們的目標。當需要直接使用暴力的時候，MCD會僱傭外圍代理人，而這些代理人與該組織的聯繫是很難被發現的。
MCD主要是透過使用金錢賄賂或者社會壓力，使得基金會的收容措施數次失效。很多基金會人員為了巨額錢財，或受到監禁和拷打威脅，將許多報告，記錄，甚至是物品洩漏出去。
值得注意的是，基金會在拒絕了MCD的成員請求後，有兩個收容設施差一點就暴露在公眾視野中。
有關MCD的資料，比如總裁名字甚至是成員列表之類的，被證明很難取得。接觸該組織的特工最好維持一個假身份，並在任何情況下都不得暴露與基金會的聯繫或者SCP物品的訊息。
"Nobody"
目前關於"Nobody"的人員，個體，組織的訊息都很少。
第一次被目擊到是在1945年，之後他們便頻繁出現。每次出現都只有一個人，通常是一名穿著灰色西裝和淺頂紳士帽的白人男性。如果被問及身份，他就答覆他是"Nobody"。
儘管如此，到底是這一個人還是一個人的多個特工目前未知，是否是代理人也未知。
他們的行為準則未知，有時幫助基金會，有時阻礙基金會。建議任何外出特工對那些自稱"Nobody"的人員時要謹慎接觸。
Office For The Reclamation of Islamic Artifacts／ 伊斯蘭物品回收辦公室-ORIA
伊斯蘭物品回收辦公室（ORIA）是一支準軍事力量，只對伊朗的最高領袖負責，並在中東和中亞回收和利用異常物品。在伊朗皇室政府被革命軍推翻後，成立了伊朗伊斯蘭共和國，所有基金會人員以“殖民者間諜”的名義被驅逐出境。試圖保持該國境內機密的行動失敗了，基金會人員大部分被殺或被捕，Site██，███和███也被伊朗軍隊佔領。為了防止伊朗在異常研究領域落後於人，ORIA由最高領袖Khomeini在1981年秘密下令組建。雖然名字如此，該組織實際上並非只限於尋找與伊斯蘭起源有關的異常物品。
儘管ORIA可以獲得相當多的重要資源，其主要努力都被用於處理組織內大量陣營的內鬥。其中一些爭論圍繞著哲學差異為中心，諸如武器化異常物品，而其他似乎都是私人性質的。其內部陣營的擴張似乎是故意的，因為ORIA組織經常派遣多個指揮官負責多個互相重疊的區域。理論上認為此類佈置是為了防止有任何一派強大到足夠最高領袖。
當伊朗霸權主義在中東和西亞擴張時，ORIA也在其領地內擴張，變成了中東最重要的超自然組織。
ORIA將被視為敵對組織，建議基金會人員在與其作戰時保持高度警惕。
Prometheus Labs， Inc.／ 普羅米修斯實驗室有限公司
普羅米修斯實驗室是由██████ ██████在1892年成立的一個基於【資料被刪除】上的科學研究和發展公司，並在數年的發展中生產了數個擁有巨大潛在市場的超自然物品。
普羅米修斯實驗室是一個口號是 「發展科技和工具直到人類達到超越自然的境界為止」的非營利性組織。
儘管沒有直接威脅到基金會，普羅米修斯實驗室自己的方案卻過於粗略並拒絕由基金會提出的對於他們某些產品進行特殊收容措施的建議。
在1998年9月1日，其中一個普羅米修斯實驗室的計劃，【資料被刪除】，導致了他們的基地設施的毀滅。
在善後工作中，基金會對廢墟中心點進行了地毯式搜索並回收了數個倖存的物品和數名倖存者。
回收的物品被標定為SCP，而人員則被吸收為基金會人員。目前基金會正試圖將普羅米修斯實驗室重新建立成一個分支機構。
>從實驗室的廢墟中回收到的SCP物品包括：
SCP-148和SCP-534。
The Serpent's Hand／ 蛇之手
蛇之手是一個小型但十分危險的組織，已經導致數次基金會收容措施失效。
目前已經接觸到三個不同的個體，所有這些人都使用可能的或者已經證實的超自然物品進行他們不為人知的目的（包括從基金會中被偷竊的SCP-268，之後在對分裂者設施的一次襲擊中被回收）。
該組織所屬人員總數、科技等級、持有的SCP物品數量，以及威脅等級全部不明。儘管如此，可以肯定的是他們危險並具有高度組織性。
目前只知道他們的首領叫“LS”，此人至少與兩起基金會設施的收容措施失效有關。
基金會目前關於蛇之手的資料非常少，而且幾乎所有關於蛇之手的訊息都來自於GOC的情報。
此組織似乎醉心於信奉超自然物品的存在和用途，尤其是類人的或者有自主意識的SCP。蛇手對隔離和銷毀SCP持嚴重反對態度，特別是那些人形SCP和沒有多大破壞力的SCP。
該組織和混沌分裂者以及AGIR的關係都不太友好，和GOC的關係則是極端惡劣。唯一關於蛇之手成員涉及無端暴力的記錄是在該組織對抗GOC特工時獲取的。
>請參閱incident-report-x23。
Unusual Incidents Unit （UIU）， Federal Bureau of Investigation／ 聯邦調查局所屬特異事故單位
被整個FBI戲稱為“X檔案”（David Duchovny 和Gillian Anderson主演的電視劇）的UIU成立於SCP-███收容失敗並導致超自然活動並被公眾發現的事故後。雖然在之後被揭穿是一個████ █████████ █████████，一份由██（███）的███████ ██ ████議員發表的編號HR██████的附文要求成立一個可以快速反應的特殊FBI部門，致力於應付超自然事件和涉及超自然問題的犯罪。因為當時FBI局長██████對這份官方文件進行的抗議可能會引起質疑，於是UIU就以“研究和處理超自然現象”的名義於████年██月██日成立了。
UIU的成員大都是好人，雖然他們缺乏有效的培訓和資源，往往使得他們在現場手忙腳亂。早先試圖從UIU招募成員的努力顯然失敗了。UIU被普遍認為是職業生涯的死胡同，該單位往往只能吸引FBI的最底層的人才。志願調入UIU的人員很少，他們大多數都表現得較容易輕信和盲從他人。因此，從UIU招募的人員至少要有和普通FBI特工同樣的素質。
如果UIU獲得了一個真正的SCP物品，基金會人員應該透過聯繫位於██████████的██辦公室的███████副主任回收並調換一個假貨。因為當UIU進入一個牽涉到基金會在內的衝突地區進行行動時有可能發生意外，因此建議在這些方案中使用標準”黑衣人“偽裝模式。
UIU中的FBI特工捲入了基金會對IRG的偵查行動中，詳細情況記錄在文檔I.215.02，Bowe委員會報告。
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